航空运输中防止虫害入侵的方法如下：

集装箱在装货前应检查是否被其他昆虫污染。

集装箱在装载货物后应进行密封，防止昆虫进入。

在集装箱运输过程中，如果发现有昆虫活动，应立即采取措施消灭昆虫，并对集装箱进行密封处理。

如果发现有大量昆虫活动，应立即将情况通知机场管理部门，机场管理部门应立即采取措施消灭昆虫，并对货物进行必要的处理。